W 2004 roku Sąd Apelacyjny we Wrocławiu skazał Tomasza Komendę na karę 25 lat pozbawienia wolności za zgwałcenie i zabójstwo 15-letniej Małgorzaty Kwiatkowskiej w Miłoszycach, co zakończyło postępowanie karne przeciwko niemu. Wyrok ten podważył wcześniejszy werdykt Sądu Okręgowego we Wrocławiu z listopada 2003 roku, który orzekł 15 lat więzienia w I instancji. Sąd Najwyższy odrzucił kasację wyroku Sądu Apelacyjnego we Wrocławiu jako bezzasadną, zgodnie z postanowieniem z 12 maja 2005 roku (sygnatura akt V KK 411/04, opublikowano w LEX nr 151682). Tomasz Komenda odbywał karę w Zakładzie Karnym w Strzelinie, a w marcu 2018 roku sąd penitencjarny przy Sądzie Okręgowym we Wrocławiu warunkowo zwolnił go z odbywania kary po 18 latach, wypuszczając na wolność. 16 maja 2018 roku Sąd Najwyższy uniewinnił Tomasza Komendę.

W marcu 2018 roku sondaż opublikowany przez Wirtualną Polskę wykazał, że 89% Polaków miało świadomość sprawy Tomasza Komendy. Dziennikarz Superwizjera TVN Grzegorz Głuszak spisał wspomnienia niesłusznie skazanego w książce zatytułowanej „25 lat niewinności. Historia Tomasza Komendy”, wydanej 11 września 2018 przez wydawnictwo Znak Literanova. Za reportaż na antenie TVN o tej samej tematyce Głuszak otrzymał 1 grudnia 2018 roku nagrodę MediaTory w kategorii DetonaTOR, a w listopadzie 2018 roku wyróżnienie honorowe Nagrody im. Andrzeja Woyciechowskiego.